Det antas at de første menneskene slo seg ned i Skiptvet for 8-9 tusen år siden, og da spesielt langs Glomma hvor leveforholdene var gunstige. I middelalderen hørte Skiptvet til Vingulmork. Senere ble denne landsdelen kalt Østfold da den lå på østre side av Oslofjorden.
Kommunen er en typisk jord- og skogbrukskommune, og har tidligere vært senter for tømmerfløting. Skiptvet har gjennom tidene ikke hatt noen egentlig industri å snakke om. Den første bedriften som ble opprettet, var Skiptvet meieri. Virksomheten har hatt betydning fordi det har grodd fram en liten tettbebyggelse omkring dette meieriet, og det er også grunnlaget for at sentrum i Skiptvet blir kalt Meieribyen.
Det foreligger flere tolkninger av bygdenavnet Skiptvet, men ingen er sikre.